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2020年1月27日,星期一

基因组学专家对与先天性心脏病有关的九个基因提出质疑

由美国国立卫生研究院资助的ClinGen研究小组还验证了三个与长QT综合征相关的基因。

全世界的遗传学家和心脏专家以前曾报告过17种基因,这些基因会导致长期QT综合征,这是一种鲜为人知的遗传性心脏病。然而 临床基因组资源(ClinGen) 专家小组严格评估了所有17个已报告基因的科学证据,对其中9个基因产生了争议,并且仅揭示了与该疾病最常见形式绝对相关的3个基因。这项工作是由美国国立卫生研究院的国家人类基因组研究所(NHGRI)资助的。

ClinGen是NHGRI资助的资源,用于定义各种遗传性疾病中基因的临床相关性或有效性,以用于精密医学和研究。其他九个基因已被归类为具有有限或有争议的证据导致该综合征。他们的结果是 出版于 循环,美国心脏协会的同行评审杂志。

心脏正常,节律异常

二十年前, 纽约时报 已发表 一篇关于三个“看起来健康”的年轻人的文章,他们在睡觉,游泳和踢足球后以看似神秘的方式死亡。 2019年,约有4,000名儿童和年轻人以类似的不同寻常的方式在美国死亡。明显的原因是长QT综合征。

长QT综合征 是由调节心脏电活动的基因突变引起的。这些突变可导致心脏突然,不规则的心律或心律不齐。很像 纽约时报 文章指出,患有长QT综合征的人可能会出现无端的心律失常,或者是压力和运动导致的。但是当发生心律不齐时,它们可能是致命的。    

许多患有长QT综合征的人可能不知道自己是否患有这种疾病,除非他们获得无关的心电图,了解其家族病史并接受了基因检测。术语“ QT”是指心电图的片段,该片段测量心跳后心脏放松的持续时间。在长QT综合征中,持续时间异常延长,并容易导致危险的心律失常。

自从1957年对这种综合征进行描述以来,研究人员就参与了一场遗传竞赛,以鉴定与长QT综合征相关的基因,该基因目前包括17个基因。

通过使用这种标准化的,基于证据的框架,长期QT综合征的国际ClinGen专家组能够将17个基因分类为特定的组。

三个基因 KCNQ1, KCNH2SCN5A, 有足够的证据被认为是典型的长QT综合征的“确定性”遗传原因。其他四个基因有强有力或确定的证据支持它们在引起非典型形式的长QT综合征中的作用,在新生儿期出现相关的心脏传导阻滞,癫痫发作或发育延迟。其余的十个基因没有足够的证据支持该综合征的因果作用。实际上,这10个剩余基因中有9个被置于有限或有争议的类别中。该研究的作者建议,在评估患有QT长期综合征的患者和家庭时,不对这些基因进行常规临床检查,因为它们缺乏引起这种情况的足够科学证据。

ClinGen是精准医学必不可少的资源

基因测试提供者使用研究论文来确定将哪些基因包括在他们的测试面板中,以便向医生进行诊断报告。报告基因疾病相关性的已发表论文在其研究设计和支持其结论的证据强度方面差异很大。直到最近,还没有标准的准则来区分具有强大而有效的科学方法的基因与缺乏证据的基因。

国家卫生研究院开发了ClinGen资源来解决这个问题。 

ClinGen的专家小组包括研究人员,临床医生和遗传咨询师,他们运用基于证据的框架评估研究论文中的科学证据,以将基因疾病关系置于“确定的”,“强的”,“中等的”,“有限的”,“有争议的” ”或“被驳回”类别。

“ ClinGen是令人印象深刻的社区努力。来自30个国家/地区的1,000多名研究人员和临床医生自愿提供时间和专业知识,ClinGen正在为临床基因组学界提供急需的清晰度,说明哪些基因疾病对具有足够的临床证据,” ClinGen的项目科学家,NHGRI基因医学部项目总监。

临床用途

“我们的研究强调需要退后一步,并严格评估所有报告的基因-疾病关联的证据水平,尤其是在将基因检测用于我们患者的诊断目的时。该论文的资深作者,多伦多总医院研究所研究员Michael Gollob说:“测试没有足够证据来支持疾病原因的基因只会带来错误解释遗传信息并导致患者伤害的风险。” 

此外,测试与长期QT综合征不明确相关的基因可能会导致不适当和昂贵的医疗干预,例如植入心脏复律除颤器,这是一种可以纠正危险性心律不齐的心脏设备。

ClinGen研究人员发表了类似的文章 研究 在2018年,涵盖了另一种称为Brugada综合征的心脏病。 2019年,美国人类遗传学会将论文视为基因组医学十大进展之一。

由20多个专家小组负责研究不同疾病-乳腺癌和卵巢癌,青光眼和家族性高胆固醇血症-定期对许多基因疾病对进行分类,目的是随着时间的推移加快可靠和有用的基因检测的发展。

关于国家人类基因组研究所(NHGRI):NHGRI是美国国立卫生研究院(NIH)的27个研究所和中心之一,NIH是卫生与公共服务部的一个机构。 国家卫生研究院内部研究部开发并实施了用于理解,诊断和治疗基因组和遗传疾病的技术。有关NHGRI的其他信息,请参见: //www.genome.gov.

关于国立卫生研究院(NIH): 美国国立医学研究院(NIH)是美国的医学研究机构,包括27个研究所和中心,并且是美国卫生与公共服务部的一部分。 NIH是进行和支持基础,临床和转化医学研究的主要联邦机构,并且正在调查常见和罕见疾病的病因,治疗方法和治愈方法。有关NIH及其计划的更多信息,请访问 www.nih.gov.

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