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2008年12月15日,星期一

NIH扩展了遗传和临床数据的开放获取数据集,以包括哮喘

行动创建了最大的哮喘临床和遗传数据公共访问集合

美国国立卫生研究院的国立心脏,血液和血液研究所(NHLBI)扩大了其遗传和临床数据的收集范围,该数据库于去年首次向全球研究人员免费提供,其中包括从三个哮喘研究网络收集的临床和遗传信息。在2007年,NHLBI发起了SHARe(SNP健康协会资源),这是一个基于Web的数据集,可从弗雷明汉心脏研究开始,为合格的研究人员免费访问来自多个大型人群研究的大量数据。 美国国家卫生研究院也资助了这个名为SHARe-哮喘资源项目(SHARP)的项目的新扩展。

SHARP包含有关2,332名哮喘患者和805个家庭的数据,这些家庭的DNA经过了100万种遗传变异测试。此外,数据库还包括哮喘临床试验期间收集的临床数据,例如肺功能,过敏状态和呼吸道症状。这样,SHARP将使研究人员能够将研究参与者的遗传变异与他们的临床和实验室测试结果相关联,从而使将来能够发现基因与哮喘和其他气道疾病的健康之间的联系。为了保护同意共享其医学数据的研究参与者的机密性,该数据库不包含任何个人信息。

美国国家卫生研究院主任伊丽莎白·纳​​贝尔说:“ NIH致力于广泛共享研究信息,同时也为我们有价值的研究志愿者的隐私和机密提供最大的保障,通过SHARP计划扩展SHARE计划,将哮喘纳入其中。使用遗传和基因组技术极大地扩展了我们对肺部疾病生物学的理解。”

提供数据的三个哮喘临床研究网络是儿童哮喘管理计划(CAMP),儿童哮喘研究和教育网络(CARE)和哮喘临床研究网络(ACRN),它们均由NHLBI资助。十多年来,这些网络一直是有关哮喘护理最佳实践的主要信息来源,可为患者和医师翻译和开发新知识。

美国国家卫生研究院肺病科主任James P. Kiley博士说:“多年来,临床哮喘网络一直是我们在NHLBI进行转化研究计划的骨干。” “创造这种新资源不仅为我们自己的网络研究人员提供了使用这些独特数据的新机会,而且还向更广泛的科学界开放了它。”

可通过dbGaP或基因型和表型数据库访问SHARP数据(http://view.ncbi.nlm.gratlusbc.net/dbgap),这是一个基于Web的资源,用于存档和分配全基因组关联研究(GWAS)中的数据。 GWAS探索基因(基因型信息)与可观察到的性状(表型)之间的关联,例如体重,胆固醇水平或疾病的存在与否。 dbGaP于2006年12月启动,由NIH国家医学图书馆(NLM)的一个部门国家生物技术信息中心(NCBI)开发和运营。

Affymetrix Inc.通过与NHLBI的合同为SHARP生成了基因分型信息,包括来自一百万个SNP映射阵列的数据。经过适当批准的研究人员可以使用摘要数据和分析。只有符合NIH GWAS政策中概述的访问要求的授权调查员才能使用个人级别的数据(http://grants.gratlusbc.net/grants/gwas/index.htm)。禁止研究人员重新分发数据或试图确定参与者的身份。

“ SHARP的研究人员对这种合作及其促进哮喘的遗传学和基因组学的潜力感到兴奋。我们致力于紧密合作以使这项工作取得成功,不仅对网络研究人员如此,对其他人也如此。” Scott T. Weiss博士,硕士,哈佛医学院医学教授,SHARP执行委员会联席主席。

有兴趣申请访问个人级别SHARP(哮喘SHARe)数据的研究人员,应遵循以下指导: http://www.ncbi.nlm.gratlusbc.net/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000166.v1.p1

美国国立卫生研究院,国家心脏,肺和血液研究所(NHLBI)的一部分计划,开展和支持与心脏,血管,肺和血液疾病的病因,预防,诊断和治疗有关的研究,和睡眠障碍。该研究所还管理有关妇女和心脏病,儿童健康体重和其他主题的全国健康教育运动。 美国国家卫生研究院新闻稿和其他材料可从以下网站在线获得: www.nhlbi.nih.gov.

国家生物技术信息中心(NCBI)成立于1988年,是分子生物学信息的国家资源。 NCBI创建公共数据库,进行计算生物学研究,开发用于分析分子和基因组数据的软件工具,并传播生物医学信息,所有这些都是为了更好地了解影响人类健康和疾病的过程。 NCBI是国家医学图书馆的一个部门,该图书馆是世界上最大的健康科学图书馆。有关更多信息,请访问 www.nlm.nih.gov.

关于国立卫生研究院(NIH): 美国国立医学研究院(NIH)是美国的医学研究机构,包括27个研究所和中心,并且是美国卫生与公共服务部的一部分。 NIH是进行和支持基础,临床和转化医学研究的主要联邦机构,并且正在调查常见和罕见疾病的病因,治疗方法和治愈方法。有关NIH及其计划的更多信息,请访问 www.nih.gov.

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