2014年9月15日

2014年埃博拉疫情的遗传学

乍看上去

  • 科学家使用基因组测序技术来识别埃博拉病毒的起源并追踪当前非洲疫情中的传播。
  • 这些见解可能有助于指导公共卫生应对的许多方面。
链状埃博拉病毒 附着在细胞上并从细胞出芽的埃博拉病毒颗粒(绿色)的彩色扫描电子显微照片(放大25,000倍)(蓝色)。 国家国际开发署

埃博拉病毒可导致人和其他灵长类动物的严重疾病和死亡。根据世界卫生组织的数据,2014年埃博拉疫情是历史上最大的暴发,截至8月底,已有3600例感染和1800例死亡。疫情是西非的第一起疫情,也是第一起影响主要城市的疫情。

埃博拉病毒一旦从动物宿主传播给人类,便可以通过人与人之间的接触传播。症状通常在暴露后2至21天出现。感染会导致发烧,头痛,身体酸痛,虚弱,胃痛和食欲不振。后来的症状包括呕吐,腹泻,皮疹,肾和肝功能受损,在某些情况下还包括内部和外部出血(出血)。目前尚无用于治疗该疾病的药物,但及时诊断和积极的支持治疗可以提高生存率。

为了更好地了解这次疫情,由布罗德研究所(Broad Institute)和哈佛大学的帕迪斯·萨贝蒂(Pardis Sabeti)博士领导的国际团队从2014年爆发地点附近的塞拉利昂生活的78名患者中收集了病毒样本。研究人员使用先进的技术快速准确地分析了病毒基因组。这项工作部分由NIH的共同基金和美国过敏与传染病研究所(NIAID)资助。研究结果发表在 科学 在2014年9月12日。

研究人员总共对99个埃博拉病毒基因组进行了测序,因为对某些人进行了多次采样。分析显示,造成过去暴发的病毒有300多种遗传差异。造成这种暴发的病毒株早在2004年就与中部非洲的发散性有所不同,表明在过去的十年中从中部向西非转移。

研究小组还发现,随着疫情蔓延,出现了50多种突变。他们估计,2013年底首次发生了未知来源的感染,随后是人与人之间的独家传播。该病毒由几内亚附近的14个人带到塞拉利昂,该人参加了一次传统的治疗埃博拉病毒患者的葬礼。

该团队发布了所产生的所有序列数据,以帮助救援工作并加速全球研究。 Sabeti说:“通过将数据立即提供给社区,我们希望加快响应速度。”

这项研究强调了随着爆发的继续,需要持续的“基因组监测”来追踪并试图减缓这种病毒的进化。了解病毒的遗传学也将有助于开发新的和改进的药物和疫苗。

NIH在研究潜在的埃博拉疫苗和药物方面一直发挥着关键作用。它最近宣布推出一款 早期试验 开始对候选疫苗进行人体测试。

相关链接

参考文献: 基因组监测阐明了埃博拉病毒在2014年爆发期间的起源和传播。 Gire SK,Goba A,Andersen KG,Sealfon RS,Park DJ,Kanneh L,Jalloh S,Momoh M,Fullah M,Dudas G,Wohl S,Moses LM,Yozwiak NL,Winnicki S,Matranga CB,Malboeuf CM,Qu J ,格拉登(Gladden AD),沙夫纳(Schaffner SF),杨X,江PP,Nekoui M,库鲁比(Coomberri),库伯MR(Conmber MR),芬妮(Fonnie M),莫伊博伊(Moigboi)A,巴巴基(Baakie)M,卡马拉(Kamara)FK,塔克(Tucker)V,科努瓦(Kunuwa)E,萨法(Saffa),塞卢(Sellu J),贾洛(Jalloh AA),科沃马(Kovoma) A,Koninga J,Mustapha I,Kargbo K,Foday M,Yillah M,Kanneh F,Robert W,Massally JL,Chapman SB,Bochicchio J,Murphy C,Nusbaum C,Young S,Birren BW,Grant DS,Scheiffelin JS, Lander ES,Happi C,Gevao SM,Gnirke A,Rambaut A,Garry RF,Khan SH,Sabeti PC。 科学。 2014年9月12日; 345(6202):1369-72。 doi:10.1126 / science.1259657。 Epub 2014年8月28日。PMID:25214632。

资金: NIH的共同基金和美国过敏与传染病研究所(NIAID);国家科学基金会;欧洲联盟第七框架计划;世界银行;和自然环境研究委员会。