2007年2月26日

2000种流感病毒基因组和计数

感冒的不快乐男人

现在已经完成了从世界各地的样本中采集的2,000多种人类和禽流感病毒的全部基因蓝图。这些序列将帮助科学家了解流感病毒如何进化和传播,并有助于开发新的流感疫苗,疗法和诊断方法。

季节性流感是美国主要的公共卫生问题,每年造成约36,000例死亡和20万例住院治疗。季节性流感疫苗每年更新一次,以针对最新的流行病菌株。但是,开发这些疫苗具有挑战性,因为流感病毒在复制时容易出现遗传错误,而且这些突变足以改变病毒,以至于针对一种菌株的疫苗可能无法针对另一种菌株。卫生官员特别担心可能会在人与人之间轻易传播的新型高致死性病毒株的出现引起流感大流行的可能性。

由美国国立卫生研究院国家过敏和传染病研究所(NIAID)资助的流感基因组测序项目于2004年启动,旨在帮助研究人员了解流感病毒如何进化,传播和引起疾病。测序工作是在由NIAID资助的微生物测序中心进行的,该中心由基因组研究所(TIGR)管理。测序能力的提高使生产率提高到每月200多个病毒基因组。

该项目刚刚超过2,000个基因组标记,测序中心将继续对更多的流感病毒株和分离株进行测序,并通过GenBank(保持互联网访问的遗传序列数据库)将所有序列数据免费提供给科学界和公众由NIH国家医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)负责,该项目的另一主要贡献者。许多其他机构也在该项目上进行合作。

国家国际开发署 微生物测序中心负责人Maria Y. Giovanni博士说:“几年前,在公共领域仅存在关于流感病毒的有限遗传信息,而且许多序列数据不完整。”流感基因组测序项目通过大大增加流感序列数据的数量并迅速将其提供给整个科学界来填补了这一空白。随后,全世界将流感基因组序列数据保存到公共领域的科学家数量显着增加。”

国家国际开发署 还资助了BioHealthBase生物信息学资源中心,以帮助分析和解释由流感基因组测序项目产生的大量序列数据。同时,该项目的数据以及所有其他可公开获得的流感序列数据也可以通过NCBI的流感病毒资源获得,其中包括供研究人员使用的大量分析工具。

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